Il liquido zuccherino limpido proveniente dalla sezione di pretrattamento viene utilizzato come fonte di carbonio per la fermentazione. Vengono introdotti ceppi microbici qualificati e viene fornita aria sterile. La temperatura viene controllata mediante raffreddamento attraverso serpentine interne ed esterne nel serbatoio di fermentazione, mantenendo la temperatura e il volume d'aria adeguati per la fermentazione dell'acido citrico. Dopo la fermentazione, il brodo di fermentazione viene temporaneamente conservato in un serbatoio di trasferimento, quindi riscaldato e sterilizzato tramite uno scambiatore di calore. La separazione avviene tramite filtropressa a piastre, con l'invio del liquido alla sezione di estrazione ed il residuo acido umido solido essiccato in essiccatore a fascio tubiero, raffreddato mediante convogliamento d'aria, e confezionato per la vendita esterna.

Il liquido trasparente di fermentazione dell'acido citrico proveniente dalla sezione di fermentazione è diviso in due parti per la reazione di neutralizzazione del TCC e la reazione di neutralizzazione del DCC. Una parte del liquido limpido viene miscelata con acido DCC diluito ed entra nell'unità di reazione TCC per reagire con il carbonato di calcio, formando citrato di calcio. L'altra parte del liquido trasparente reagisce con il citrato di calcio prodotto dalla neutralizzazione del DCC per formare idrogeno citrato di calcio. L'impasto liquido delle reazioni di neutralizzazione del TCC e del DCC viene separato utilizzando un filtro a nastro sottovuoto. Il panello di filtrazione dell'idrogeno citrato di calcio derivante dalla neutralizzazione del DCC viene utilizzato nell'unità di reazione dell'acidolisi, dove viene miscelato con acido solforico concentrato. L'impasto liquido di reazione risultante viene separato da un filtro a nastro sotto vuoto e il filtrato viene sottoposto a ulteriore filtrazione attraverso un filtro pressa a piastre e telaio a due stadi per ottenere un liquido di acidolisi raffinato. Il panello filtrante di solfato di calcio separato dal filtro a nastro sotto vuoto viene trasportato allo stoccaggio del solfato di calcio tramite un trasportatore a coclea. Il liquido di acidolisi raffinato viene fatto passare attraverso una colonna di decolorazione e dispositivi di scambio anionico prima di essere inviato alla sezione di raffinazione per la concentrazione.

Il liquido di acidolisi raffinato proveniente dalla sezione di estrazione viene concentrato, quindi cristallizzato mediante raffreddamento. Viene separato utilizzando una centrifuga per ottenere cristalli umidi di acido citrico monoidrato. I cristalli bagnati vengono essiccati in un essiccatore a letto fluidizzato, vagliati e immessi in un contenitore di stoccaggio. Dopo la pesatura, il confezionamento e il rilevamento dei metalli, si ottiene il prodotto finale di acido citrico monoidrato.