Den klare sukkervæske fra forbehandlingssektionen bruges som kulstofkilde til gæring. Kvalificerede mikrobielle stammer introduceres, og steril luft tilføres. Temperaturen styres ved afkøling gennem interne og eksterne spoler i gæringstanken, opretholdelse af passende temperatur og luftvolumen til citronsyregæring. Efter fermentering opbevares gæringsbouillonen midlertidigt i en overførselsbeholder, hvorefter den opvarmes og steriliseres gennem en varmeveksler. Den adskilles ved hjælp af en plade-og-ramme-filterpresse, hvor væsken sendes til ekstraktionssektionen, og den faste våde syrerest tørres i en rørbundttørrer, afkøles ved lufttransport og emballeres til eksternt salg.

Den klare citronsyrefermenteringsvæske fra fermenteringssektionen er opdelt i to dele til TCC-neutraliseringsreaktion og DCC-neutraliseringsreaktion. En del af den klare væske blandes med fortyndet DCC-syre og kommer ind i TCC-reaktionsenheden for at reagere med calciumcarbonat og danne calciumcitrat. Den anden del af den klare væske reagerer med calciumcitrat produceret fra DCC-neutraliseringen for at danne calciumhydrogencitrat. Opslæmningen fra både TCC- og DCC-neutraliseringsreaktioner separeres ved hjælp af et vakuumbæltefilter. Calciumhydrogencitratfilterkagen fra DCC-neutraliseringen bruges i acidolysereaktionsenheden, hvor den blandes med koncentreret svovlsyre. Den resulterende reaktionsopslæmning adskilles med et vakuumbåndfilter, og filtratet undergår yderligere filtrering gennem en to-trins plade-og-ramme-filterpresse for at opnå raffineret acidolysevæske. Calciumsulfatfilterkagen adskilt af vakuumbåndsfilteret transporteres til calciumsulfatlageret via en skruetransportør. Den raffinerede acidolysevæske ledes gennem en affarvningskolonne og anion-kationbytteranordninger, før den sendes til raffineringssektionen til koncentrering.

Den raffinerede acidolysevæske fra ekstraktionssektionen koncentreres og krystalliseres derefter ved afkøling. Det adskilles ved hjælp af en centrifuge for at opnå våde monohydrat-citronsyrekrystaller. De våde krystaller tørres i en fluid bed-tørrer, sigtes og føres ind i en opbevaringsbeholder. Efter vejning, emballering og metaldetektion opnås det endelige monohydrat-citronsyreprodukt.