Skaidrus cukraus skystis iš pirminio apdorojimo skyriaus naudojamas kaip anglies šaltinis fermentacijai. Įvedamos kvalifikuotos mikrobų padermės, tiekiamas sterilus oras. Temperatūra kontroliuojama aušinant per vidinius ir išorinius fermentacijos bako ritinius, palaikant tinkamą temperatūrą ir oro tūrį citrinų rūgšties fermentacijai. Po fermentacijos fermentacijos sultinys laikinai laikomas perpylimo rezervuare, po to kaitinamas ir sterilizuojamas per šilumokaitį. Jis atskiriamas naudojant plokštelinį ir rėminį filtravimo presą, skystis siunčiamas į ekstrahavimo sekciją, o kietos drėgnos rūgšties likučiai džiovinami vamzdžių pluoštų džiovykloje, aušinami oro transportavimo būdu ir supakuojami išoriniam pardavimui.

Citrinų rūgšties fermentacijos skaidrus skystis iš fermentacijos skyriaus yra padalintas į dvi dalis TCC neutralizavimo reakcijai ir DCC neutralizavimo reakcijai. Viena skaidraus skysčio dalis sumaišoma su praskiesta DCC rūgštimi ir patenka į TCC reakcijos bloką, kad reaguotų su kalcio karbonatu ir susidaro kalcio citratas. Kita skaidraus skysčio dalis reaguoja su kalcio citratu, gautu neutralizuojant DCC, sudarydama kalcio vandenilio citratą. TCC ir DCC neutralizavimo reakcijų suspensija atskiriama naudojant vakuuminį juostinį filtrą. Kalcio vandenilio citrato filtro pyragas, gautas neutralizuojant DCC, naudojamas acidolizės reakcijos bloke, kur jis sumaišomas su koncentruota sieros rūgštimi. Gauta reakcijos suspensija atskiriama vakuuminiu juostiniu filtru, o filtratas toliau filtruojamas per dviejų pakopų plokštelinį ir rėminį filtro presą, kad būtų gautas rafinuotas acidolizės skystis. Vakuuminiu juostiniu filtru atskirtas kalcio sulfato filtro pyragas sraigtiniu konvejeriu transportuojamas į kalcio sulfato saugyklą. Rafinuotas acidolizės skystis perleidžiamas per spalvos pašalinimo kolonėlę ir anijonų katijonų mainų įrenginius, prieš siunčiant į rafinavimo skyrių koncentruoti.

Rafinuotas acidolizės skystis iš ekstrahavimo sekcijos koncentruojamas, po to kristalizuojamas aušinant. Jis atskiriamas centrifuga, kad būtų gauti drėgni citrinų rūgšties monohidrato kristalai. Drėgni kristalai džiovinami verdančiojo sluoksnio džiovykloje, sijojami ir paduodami į saugojimo dėžę. Pasvėrus, supakavus ir aptikus metalą, gaunamas galutinis citrinų rūgšties monohidrato produktas.